O PGCOMP - UFBA possui uma única área de concentração - Ciência da Computação - e três linhas de pesquisa na área de Ciência da Computação.
- Computação Aplicada. Esta linha de pesquisa esta á associada à área de conhecimento do CNPQ "Metodologia e Técnicas da Computação (1.03.03.00-6)".
- Engenharia de Software. Esta linha de pesquisa esta á associada à área de conhecimento do CNPQ "Metodologia e Técnicas da Computação (1.03.03.00-6)".
- Sistemas Computacionais. Esta linha de pesquisa esta á associada à área de conhecimento do CNPQ "Metodologia e Técnicas da Computação (1.03.03.00-6)".
Cada linha de pesquisa agrega sub-áreas e tópicos de pesquisa associados aos interesses de pesquisa do corpo docente do PGCOMP, e conta com o apoio de projetos de pesquisa e desenvolvimento, nacionais e internacionais, financiados por agências de fomento (CNPq, CAPES, FAPESB, FINEP, etc.) e pelo setor produtivo.